全域土地綜合整治項目的實施程序需遵循系統性、科學性和合規性原則，結合國家政策與地方實踐，一般分為以下五個階段，具體流程及要點如下：

一、前期謀劃與立項階段

潛力調查與區域劃定

以國土變更調查、土壤調查等數據為基礎，分析土地利用現狀、耕地質量、生態本底等，識別耕地碎片化、建設用地低效等問題。

劃分實施單元：優先以鄉鎮為單元（可跨鄉鎮），選擇整治需求迫切、群眾基礎好的區域，確保連片推進。負面清單篩查：排除違背農民意愿、破壞生態紅線、變相占用永久基本農田等情形。

立項申請與方案預審

提交材料：整治區域矢量圖、資金預算、村民意見（需2/3以上同意）、權屬調整方案等。

省級備案：縣級政府將實施方案逐級報省級自然資源部門備案，涉及永久基本農田調整的需省級農業農村部門審核。

二、方案編制與審批階段

實施方案編制

內容框架：明確整治目標（如新增耕地≥5%）、農用地整理（耕地集中連片）、建設用地整理（拆舊復墾）、生態修復（水土流失治理）等任務。

規劃銜接：與村莊規劃、“三區三線”調整方案同步編制，確保耕地和永久基本農田布局優化符合國土空間規劃。

審批與合規審查

省級聯合審查：組織專家對實施方案的科學性、合規性（如耕地占補平衡、生態保護）進行論證，重點審查永久基本農田調整是否超5%。

村莊規劃更新：同步更新村莊規劃數據庫，并納入國土空間規劃“一張圖”系統。

三、項目實施階段

子項目立項與實施

分類立項：農用地整理（高標準農田建設）、建設用地整理（宅基地復墾）、生態修復（河道治理）等子項目分別立項，鼓勵整體打包審批。

投融資模式：采用“投資人+EPC”或PPP模式，引入社會資本參與（如河南自然資源投資集團投資5.4億元整治36萬畝農田）。

過程監管：執行項目法人制、招投標制、監理制，定期開展進度檢查與資金審計。

權屬調整與表土剝離

土地流轉：通過互換并地、土地托管等方式集中耕地，保障農民權益。

表土剝離：施工前剝離表層土用于后期復墾，提升土壤質量。

四、驗收考評階段

子項目驗收

行業驗收：農業農村、水利等部門按標準驗收單項工程（如高標準農田建設質量），形成驗收報告。

指標核定：新增耕地、建設用地節余指標需經自然資源部門認定并備案。

整體驗收

綜合審查：區縣政府組織多部門驗收，重點核查任務完成率、資金使用合規性、檔案完整性。

績效評價：省級對整治效果（如耕地質量提升、生態改善）進行評分，不合格項目限期整改。

五、后期管護與指標交易

工程管護

責任落實：簽訂3年以上管護協議，明確農田水利設施、生態修復工程的維護主體。

動態監測：通過衛星遙感監測耕地“非糧化”和生態修復成效。

指標交易與收益分配

指標入市：節余建設用地指標可在省域內交易，收益反哺農村基礎設施建設和產業振興。

資金平衡：政府獎補（如廣東省高標準農田建設補貼）與社會資本收益分成并行。

典型案例參考

河南遂平縣：通過“定制化”整治36萬畝永久基本農田，吸引社會資本5.4億元，新增耕地用于糧食生產。

山東新泰市：采用“投資人+EPC”模式整治12萬畝土地，政府零投入，新增耕地2萬余畝。

注意事項

禁止行為：嚴禁未批先建、破壞古樹名木、突破生態保護紅線等。

政策銜接：涉及“三區三線”調整的，需同步更新全國國土空間規劃數據庫。

通過以上流程，全域土地綜合整治可實現耕地保護、生態修復與鄉村振興的協同推進。具體實施中需結合地方實際，靈活調整實施路徑，確保項目可持續性。