全域國土綜合整治項目的立項流程需遵循“規劃引領、統籌實施、嚴格監管”原則，具體步驟如下：

一、立項主體與責任

縣（市、區）人民政府是項目實施主體，負責組織自然資源等部門編制實施方案，并報省級備案。需成立由縣級政府主導的跨部門協調機制，統籌整合財政資金、社會資本等多元化投入。

二、立項條件與前期準備

實施單元要求

以2個及以上相鄰完整行政村為基本單元，整村或整鄉推進；優先選擇整治需求迫切、群眾基礎好的區域，確保連片推進。

規劃銜接

需與國土空間規劃、村莊規劃同步編制，明確“三生”空間優化布局；涉及永久基本農田調整的，需同步提交《永久基本農田調整方案》并通過省級論證。

負面清單篩查

禁止違背農民意愿搞合村并居、破壞生態紅線、變相占用永久基本農田等情形；新增耕地面積需≥原有耕地的5%，永久基本農田調整后質量與布局需提升。

三、方案編制與申報

材料提交

包括整治區域矢量圖、資金預算、村民意見（2/3以上同意）、權屬調整方案等；需提供《村莊規劃調整方案》《永久基本農田調整方案》及相關部門意見。

初審與上報

市級自然資源部門組織初審，形成排序名錄表后報送省級；涉及跨區域或重大工程的，需省級統籌協調。

四、評審與備案

省級競爭性評審

省級自然資源部門組織專家對方案的科學性、合規性（如耕地占補平衡、生態保護）進行論證；重點審查永久基本農田調整是否超5%、資金平衡方案是否可行。

備案與實施

通過評審的項目準予備案，納入省級項目庫；縣級政府下達立項總批復，自然資源部門對子項目不再重復立項。

五、注意事項

資金保障：需明確財政配套、社會資本參與等資金籌措方案，確保項目資金平衡；公眾參與：需通過村民會議、公示等程序保障農民知情權與監督權；動態調整：確需變更控制性指標的，需經市級審查后報省級備案。

通過以上流程，可實現耕地保護、生態修復與鄉村振興的協同推進。具體操作中需結合地方政策細化，例如湖北省要求項目區集中連片面積不低于5000畝，河南省則通過“投資人+EPC”模式吸引社會資本參與。